Open Collections

Page Metadata

Item Metadata

Title	Identificando observaciones únicas en imágenes microscópicas de superresolución STORM mediante un modelo espacio-temporal.
Creator	Herrera Reyes, Alejandra Donaji
Publisher	Banff International Research Station for Mathematical Innovation and Discovery
Date Issued	2018-06-14T09:19
Description	La microscopía de reconstrucción óptica estocástica (STORM, por sus siglas en inglés) es una técnica de microscopía de superresolución que usa fluoróforos fotoconmutables para separar temporalmente la fluorescencia y alcanzar una resolución por debajo de los 20 nm. Sin embargo, la característica principal de los fluoróforos fotoconmutables de activarse y desactivarse, podría afectar la unicidad de cada observación. Mi proyecto consiste en estimar cuántos fluoróforos distintos hay en una imagen STORM mediante modelos matemáticos y utilizando la información espacial independientemente de la temporal en dicha imagen. Suponemos que la serie de tiempo se comporta como una cadena de Markov, mientras que la incertidumbre espacial obedece un modelo de mezclas gaussianas. Usamos máxima verosimilitud para estimar los parámetros, incluyendo el número de fluoróforos. Tal procedimiento es un problema de optimización mixta (con parámetros de dominio entero y otros de dominio continuo) y computacionalmente intenso. Para resolver esto, desarrollamos un algoritmo jerárquico y paralelo donde optimizamos la verosimilitud de los parámetros temporales como una función de los parámetros espaciales y el número de fluoróforos. El algoritmo se ha probado en datos simulados y lo usaré para mejorar cuantitativamente imágenes de células B, una de las principales integrantes de nuestro sistema inmune.
Extent	45.0
Subject	Mathematics Math science education
Geographic Location	Oaxaca (Mexico : State)
Type	Moving Image
FileFormat	video/mp4
Language	eng
Notes	Author affiliation: University of British Columbia
Series	BIRS Workshop Lecture Videos (Oaxaca (Mexico : State))
Date Available	2019-03-25
Provider	Vancouver : University of British Columbia Library
Rights	Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
DOI	10.14288/1.0377420
URI	http://hdl.handle.net/2429/69178
Affiliation	Non UBC
Peer Review Status	Unreviewed
Scholarly Level	Graduate
Rights URI	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
AggregatedSourceRepository	DSpace

Download

Media

48630-201806140919-HerreraReyes_lrv.mp4 [ 225.79MB ]

Metadata

JSON: 48630-1.0377420.json

JSON-LD: 48630-1.0377420-ld.json

RDF/XML (Pretty): 48630-1.0377420-rdf.xml

RDF/JSON: 48630-1.0377420-rdf.json

Turtle: 48630-1.0377420-turtle.txt

N-Triples: 48630-1.0377420-rdf-ntriples.txt

Original Record: 48630-1.0377420-source.json

Citation

48630-1.0377420.ris

Cite

Usage Statistics

Share

Embed

Customize your widget with the following options, then copy and paste the code below into the HTML of your page to embed this item in your website.

Include Metadata Specify width in pixels (leave blank for auto-width):

                        
                            <div id="ubcOpenCollectionsWidgetDisplay">
                            <script id="ubcOpenCollectionsWidget"
                            src="{[{embed.src}]}"
                            data-item="{[{embed.item}]}"
                            data-collection="{[{embed.collection}]}"
                            data-metadata="{[{embed.showMetadata}]}"
                            data-width="{[{embed.width}]}"
                            async >
                            </script>
                            </div>
                        
                    

Our image viewer uses the IIIF 2.0 standard. To load this item in other compatible viewers, use this url:

https://iiif.library.ubc.ca/presentation/dsp.48630.1-0377420/manifest

Comment

Related Items